蛋白质序列数据库的数据库分类

一级核酸数据库、二级核酸数据库、蛋白质数据库一级蛋白质数据库三大类。具体如下:一级核酸数据库:存储的是通过各种科学手段得到的最直接的基础数据。如测序获得的核酸序列等。

蛋白质数据库有哪些(蛋白质数据库有哪些内容)

国际著名的三大蛋白质数据库有UniProt数据库、The Human Protein Atlas数据库、PhosphoSitePlus数据库。

PIR国际蛋白质序列数据库(PSD)是由蛋白质信息资源(PIR)、慕尼黑蛋白质序列信息中心(MIPS)和日本国际蛋白质序列数据库(JIPID)共同维护的国际上最大的公共蛋白质序列数据库,可在这里下载。

化学信息数据库的类型有哪些

scifinder除可查询每日更新的CA数据回溯至 1907年外,更提供读者自行以图形结构式检索。它是全世界最大、最全面的化学和科学信息数据库。seek68文献馆致力于最大化的整合中外数据库资源。

reaxys和scifinder是有机化学比较好也比较常用的两个数据库。区别在于:scifinder查的更全,reaxys分类和界面更好用,但是有遗漏。建议两个数据库可结合起来查询会更全面些。

有机化学类数据库存储的是与有机化学领域有关的各类信息。

SCI(科学引文索引 ):(Science Citation Index, SCI)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库,其覆盖生命科学、临床医学、物理化学、农业、生物、兽医学、工程技术等方面的综合性检索刊物。

蛋白质三维结构数据库的介绍

蛋白质**结构数据库是《生物信息学》里面的内容。

PDB是目前最主要的收集生物大分子(蛋白质、核酸和糖)5维(以二维的形式表示三维的数据)结构的数据库,是通过X射线单晶衍射、核磁共振、电子衍射等实验手段确定的蛋白质、多糖、核酸、**等生物大分子的三维结构数据库。

主要是蛋白质的三维结构,还包括核酸、糖类、蛋白质与核酸复合物的三维结构。信息**的空间坐标、引用文献、形成α-helix和β-sheet的氨基酸序列、双硫键连结模式、与蛋白质结合的ligand、参与生化功能的residue等。

蛋白质数据库(HPDB),建于2005年5月, 动态展示生物大分子立体结构,鼠标点击放大分子结构、**定位、测定**之间距离,可用于教学或科研。

UniProt数据库 蛋白组学常用数据库UniProt(全称UniProt Protein Resource),建立于1986年,由Swiss-Protein、TrEMBL、PIR-PSD三大蛋白质数据库联合成立的,其信息量丰富、资源广泛,是目前公认的首选免费蛋白质数据库。

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